Миссия невыполнима: Протокол Фантом

События начинаются с того, что на территории России террористы взрывают главную достопримечательность страны – Московский Кремль. Это накаляет отношения между сверхдержавами, и чтобы как-то погасить их, правительство Америки расформировывает спецподразделение. Итана снова обвиняют в преступлении, к которому он не имеет отношения. Вместе со своей командой он потерял поддержку со стороны своего руководства и страны. Их опозорили и смешали с грязью. Теперь им предстоит провести собственное расследование, чтобы отыскать виновных и вернуть свое доброе имя. Но без поддержки сделать это будет не так-то просто.